MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 98999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021984	AGAC	2	8	43	50	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021984	ACA	2	6	71	76	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021984	CAC	3	9	94	102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_021984	ACC	2	6	107	112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021984	A	6	6	164	169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021984	T	8	8	193	200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021984	AAC	2	6	220	225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021984	CGG	2	6	244	249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218782
9	NC_021984	ACCA	2	8	356	363	50 %	0 %	0 %	50 %	529218782
10	NC_021984	TGG	2	6	366	371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218782
11	NC_021984	GAT	2	6	373	378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218782
12	NC_021984	A	6	6	381	386	100 %	0 %	0 %	0 %	529218782
13	NC_021984	CGG	2	6	391	396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218782
14	NC_021984	T	6	6	435	440	0 %	100 %	0 %	0 %	529218782
15	NC_021984	GC	3	6	465	470	0 %	0 %	50 %	50 %	529218782
16	NC_021984	CTG	2	6	554	559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218782
17	NC_021984	CGC	2	6	583	588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
18	NC_021984	A	6	6	606	611	100 %	0 %	0 %	0 %	529218782
19	NC_021984	GATC	2	8	667	674	25 %	25 %	25 %	25 %	529218782
20	NC_021984	CGC	2	6	748	753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
21	NC_021984	CCG	2	6	798	803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
22	NC_021984	TGG	2	6	822	827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218782
23	NC_021984	CCG	3	9	855	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
24	NC_021984	GCC	2	6	869	874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
25	NC_021984	CTG	2	6	889	894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218782
26	NC_021984	GCT	2	6	958	963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218782
27	NC_021984	CT	3	6	995	1000	0 %	50 %	0 %	50 %	529218782
28	NC_021984	TTC	2	6	1017	1022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218782
29	NC_021984	CGA	2	6	1123	1128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218782
30	NC_021984	AAC	2	6	1163	1168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218782
31	NC_021984	GAT	2	6	1207	1212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218782
32	NC_021984	GGC	2	6	1219	1224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218782
33	NC_021984	CGC	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
34	NC_021984	GGT	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218782
35	NC_021984	TCC	2	6	1280	1285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529218782
36	NC_021984	TG	3	6	1307	1312	0 %	50 %	50 %	0 %	529218782
37	NC_021984	GC	3	6	1326	1331	0 %	0 %	50 %	50 %	529218782
38	NC_021984	CCG	2	6	1336	1341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
39	NC_021984	GCT	2	6	1381	1386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218782
40	NC_021984	TGT	2	6	1426	1431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218782
41	NC_021984	TTC	2	6	1472	1477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218782
42	NC_021984	AATATC	2	12	1496	1507	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	529218782
43	NC_021984	TCT	2	6	1526	1531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218782
44	NC_021984	TGG	2	6	1548	1553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218782
45	NC_021984	ACG	2	6	1560	1565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218782
46	NC_021984	CCA	2	6	1569	1574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218782
47	NC_021984	CGG	2	6	1645	1650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218782
48	NC_021984	CGG	2	6	1654	1659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218782
49	NC_021984	GAA	2	6	1699	1704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218782
50	NC_021984	GCG	2	6	1728	1733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218782
51	NC_021984	ATC	2	6	1857	1862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218782
52	NC_021984	TTG	2	6	1878	1883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218782
53	NC_021984	TCG	2	6	1976	1981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218782
54	NC_021984	ACT	2	6	1986	1991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218782
55	NC_021984	CGC	3	9	2008	2016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
56	NC_021984	CTG	2	6	2090	2095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218782
57	NC_021984	TGA	2	6	2104	2109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218782
58	NC_021984	CT	3	6	2144	2149	0 %	50 %	0 %	50 %	529218782
59	NC_021984	TC	3	6	2182	2187	0 %	50 %	0 %	50 %	529218782
60	NC_021984	GC	3	6	2204	2209	0 %	0 %	50 %	50 %	529218782
61	NC_021984	CG	3	6	2235	2240	0 %	0 %	50 %	50 %	529218782
62	NC_021984	GAC	2	6	2402	2407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218782
63	NC_021984	GCC	2	6	2414	2419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
64	NC_021984	TGA	2	6	2437	2442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218782
65	NC_021984	AGGTA	2	10	2443	2452	40 %	20 %	40 %	0 %	529218782
66	NC_021984	TAT	2	6	2576	2581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218782
67	NC_021984	TGC	2	6	2598	2603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218782
68	NC_021984	ATG	2	6	2622	2627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218782
69	NC_021984	CGG	3	9	2631	2639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218782
70	NC_021984	AGC	2	6	2807	2812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021984	GCC	2	6	2858	2863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_021984	A	7	7	2950	2956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021984	CGT	2	6	2996	3001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021984	CGC	2	6	3002	3007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_021984	ATGA	2	8	3018	3025	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021984	GCA	2	6	3097	3102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021984	TGA	2	6	3148	3153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021984	GAA	2	6	3156	3161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021984	ATT	2	6	3168	3173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021984	CAG	2	6	3177	3182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021984	TGA	2	6	3194	3199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021984	ATTGC	2	10	3286	3295	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_021984	CG	4	8	3371	3378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021984	GC	3	6	3426	3431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021984	CGG	2	6	3573	3578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021984	AGT	2	6	3586	3591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021984	CAG	2	6	3677	3682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218783
88	NC_021984	T	8	8	3687	3694	0 %	100 %	0 %	0 %	529218783
89	NC_021984	TGA	2	6	3730	3735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218783
90	NC_021984	GCA	2	6	3805	3810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218783
91	NC_021984	CG	3	6	3830	3835	0 %	0 %	50 %	50 %	529218783
92	NC_021984	CGG	2	6	3928	3933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218783
93	NC_021984	GCG	2	6	3966	3971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218783
94	NC_021984	CGGCG	2	10	4012	4021	0 %	0 %	60 %	40 %	529218783
95	NC_021984	GTC	2	6	4058	4063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218783
96	NC_021984	CG	3	6	4074	4079	0 %	0 %	50 %	50 %	529218783
97	NC_021984	GGC	2	6	4121	4126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218783
98	NC_021984	TGA	2	6	4192	4197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218783
99	NC_021984	GAA	2	6	4199	4204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218783
100	NC_021984	GCC	2	6	4251	4256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218783
101	NC_021984	CTA	2	6	4273	4278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218783
102	NC_021984	CTG	2	6	4370	4375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218783
103	NC_021984	CGC	2	6	4411	4416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218783
104	NC_021984	GATG	2	8	4501	4508	25 %	25 %	50 %	0 %	529218783
105	NC_021984	CAGC	2	8	4510	4517	25 %	0 %	25 %	50 %	529218783
106	NC_021984	GGA	2	6	4537	4542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218783
107	NC_021984	CCG	2	6	4549	4554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218783
108	NC_021984	CTGA	2	8	4568	4575	25 %	25 %	25 %	25 %	529218783
109	NC_021984	GCG	2	6	4586	4591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218783
110	NC_021984	ACA	2	6	4609	4614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218783
111	NC_021984	GCG	2	6	4661	4666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218783
112	NC_021984	AAAG	2	8	4748	4755	75 %	0 %	25 %	0 %	529218783
113	NC_021984	GCT	2	6	4822	4827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218783
114	NC_021984	CAT	2	6	4832	4837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218783
115	NC_021984	CTGC	2	8	4838	4845	0 %	25 %	25 %	50 %	529218783
116	NC_021984	GCC	2	6	4853	4858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218783
117	NC_021984	TGA	3	9	4869	4877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218783
118	NC_021984	GTG	2	6	4930	4935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021984	TG	3	6	5016	5021	0 %	50 %	50 %	0 %	529218784
120	NC_021984	TCA	2	6	5031	5036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218784
121	NC_021984	AAT	2	6	5096	5101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218784
122	NC_021984	TCA	2	6	5110	5115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218784
123	NC_021984	CG	3	6	5119	5124	0 %	0 %	50 %	50 %	529218784
124	NC_021984	T	6	6	5126	5131	0 %	100 %	0 %	0 %	529218784
125	NC_021984	ACC	2	6	5145	5150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218784
126	NC_021984	TCA	2	6	5169	5174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218784
127	NC_021984	TTC	2	6	5208	5213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218784
128	NC_021984	CAC	3	9	5252	5260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218784
129	NC_021984	CG	3	6	5338	5343	0 %	0 %	50 %	50 %	529218784
130	NC_021984	AG	3	6	5420	5425	50 %	0 %	50 %	0 %	529218784
131	NC_021984	TGT	2	6	5436	5441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218784
132	NC_021984	CAAAAT	2	12	5446	5457	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	529218784
133	NC_021984	CGT	2	6	5461	5466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218784
134	NC_021984	GCG	2	6	5623	5628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218784
135	NC_021984	GCT	2	6	5656	5661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218784
136	NC_021984	AATCAG	2	12	5741	5752	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	529218784
137	NC_021984	A	7	7	5792	5798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021984	CGC	2	6	5799	5804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_021984	CG	3	6	5839	5844	0 %	0 %	50 %	50 %	529218785
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255	NC_021984	T	6	6	11275	11280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_021984	ATC	2	6	11940	11945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218790
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399	NC_021984	ATC	2	6	17604	17609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
400	NC_021984	GAT	2	6	17616	17621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
401	NC_021984	T	6	6	17638	17643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_021984	ACT	2	6	17756	17761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218796
403	NC_021984	CAA	2	6	17787	17792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218796
404	NC_021984	GAT	2	6	17795	17800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218796
405	NC_021984	AATA	2	8	17843	17850	75 %	25 %	0 %	0 %	529218796
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430	NC_021984	AGAGC	2	10	19219	19228	40 %	0 %	40 %	20 %	529218796
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434	NC_021984	TTC	2	6	19324	19329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218796
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446	NC_021984	GACCAT	2	12	19901	19912	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
447	NC_021984	A	6	6	19954	19959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_021984	AAC	2	6	20127	20132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
451	NC_021984	ATC	2	6	20133	20138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_021984	TAA	2	6	20141	20146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_021984	CGTCAT	2	12	20251	20262	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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457	NC_021984	GC	3	6	20503	20508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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462	NC_021984	GCC	2	6	20673	20678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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464	NC_021984	TACCG	2	10	20897	20906	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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